De gemeente Holdorf ligt aan de noord-westrand van het natuurpark Dümmer See en noordwestelijk van de stad Damme en de Dammer Bergen.
Naast het kerkdorp Holdorf zelf, behoren Amtern, Diekhausen, Fladder, Fladderlohausen, Gramke, Grandorf, Handorf, Holdorf-Bahnhof, Ihorst, Langenberg Scheelenhorst en Wahlde ook tot de gemeente Holdorf.